ХАРАКТЕРИСТИКА ПОЛИМОРФИЗМА ПЕРВИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНА AVR4 ООМИЦЕТА PHYTOPHTHORA INFESTANS (MONT.) DE BARY
Аннотация
В работе приводится описание полиморфизма первичной структуры гена вирулентности Avr4 оомицета P. infestans в полевых образцах P. infestans из Московской и Владимирской областей. В частности, в нуклеотидных последовательностях гена Avr4 было выявлено четыре сайта однонуклеотидного полиморфизма, которые можно отнести к горячим точкам мутагенеза (положения 180, 278, 376 и 439). В зависимости от нуклеотидного состава в вышеуказанных положениях среди нефункциональных вариантов гена Avr4 было выявлено пять аллельных вариантов. На основании полученных данных был сделан вывод о том, что ген Avr4 обладает значительным полиморфизмом первичной структуры, но для выяснения причин этого полиморфизма и характера эволюции этого гена, а также установления частот выявленных аллелей в популяциях P. infestans, необходимо проведение дополнительных популяционно-генетических исследований.
Список литературы
1. Вахрушева О.А., Недоспасов С.А. Система врожденного иммунитета у растений // Молекулярная Биология. 2011. Т. 45 (№ 1). С. 20-29.
2. Armstrong M.R. An ancestral oomycete locus contains late blight avirulence gene Avr3a, encoding a protein that is recognized in the host cytoplasm / M.R. Armstrong, S.C. Whisson, L. Pritchard et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. Vol. 102. P. 7766-7771.
3. Bent A.F., Mackey D. Elicitors, Effectors, and R Genes: The New Paradigm and a Lifetime Supply of Questions // Annu. Rev. Phytopathol. 2007. Vol. 45. Р. 399-436.
4. Bos J.I. The C-terminal half of Phytophthora infestans RXLR effector AVR3a is sufficient to trigger R3a-mediated hypersensitivity and suppress INF 1-induced cell death in Nicotiana benthamiana / J.I. Bos, T.D. Kanneganti, C. Young et al. // Plant J. 2006. Vol. 48. P. 165-176.
5. Cardenas M. Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region / M. Cárdenas, A. Grajales, R. Sierra et al. // BMC Genet. 2011. Vol. 12 (pub. 23). 13 р.
6. Elansky S. Genotypic analysis of Russian isolates of Phytophthora infestans from the Moscow Region, Siberia and Far Eeast / S. Elansky, A. Smirnov, Y. Dyakov et al. // J. Phytopathology. 2001. Vol. 149. P. 605-611.
7. Jiang R. RXLR effector reservoir in two Phytophthora species is dominated by a single rapidly evolving superfamily with more than 700 members / R. Jiang, S. Tripathy, F. Govers et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. Vol. 105. P. 4874-4879.
8. Ristaino J.B., Groves C.T., Parra G.R. PCR amplification of the Irish potato famine pathogen from historic specimens // Nature. 2001. Vol. 411. P. 695-697. 9.
9. van Poppel P., Guo J., van de Vondervoort P. et al. The Phytophthora infestans avirulence gene Avr4 encodes an RXLR-dEER effector / P. van Poppel, J. Guo, P. van de Vondervoort et al. // Mol. Plant-Microbe. Interact. 2008. Vol. 21. P. 1460-1470. 10.
10. van Poppel P., Huigen D.J., Govers F. Differential recognition of Phytophthora in-festans races in potato R4 breeding lines // Phytopathology. 2009. Vol. 99 (10). P. 1150-1155. 11.
11. van Poppel P. Recognition of Phytophthora infestans Avr4 by potato R4 is triggered by C-terminal domains comprising W motifs / P. van Poppel, R. Jiang, J. Sliwka et al. // Mol. Plant Pathol. 2009. Vol. 10 (5). P. 611-620.
Рецензия
Просмотров:
61
Послать статью по эл. почте 