geomgouГеографическая среда и живые системыGeographical Environment and Living Systems2712-76132712-7621Московский государственный областной университетgeomgou-412Research ArticleСтатьиХАРАКТЕРИСТИКА ПОЛИМОРФИЗМА ПЕРВИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНА AVR4 ООМИЦЕТА PHYTOPHTHORA INFESTANS (MONT.) DE BARYDESCRIPTION OF THE PRIMARY STRUCTURE POLYMORPHISM OF AVR4 GENE IN PHYTOPHTHORA INFESTANS (MONT.) DE BARYМартыновВ. В.MartynovV. .martynov.vik@gmail.com <mailto:martynov.vik@gmail.com>Московский государственный областной университетРоссияMoscow State Regional UniversityRussian Federation201506052022042936Copyright &#x00A9; Мартынов В.В., 20222022Мартынов В.В.Martynov V...Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.geoecosreda.ru/jour/article/view/412

В работе приводится описание полиморфизма первичной структуры гена вирулентности Avr4 оомицета P. infestans в полевых образцах P. infestans из Московской и Владимирской областей. В частности, в нуклеотидных последовательностях гена Avr4 было выявлено четыре сайта однонуклеотидного полиморфизма, которые можно отнести к горячим точкам мутагенеза (положения 180, 278, 376 и 439). В зависимости от нуклеотидного состава в вышеуказанных положениях среди нефункциональных вариантов гена Avr4 было выявлено пять аллельных вариантов. На основании полученных данных был сделан вывод о том, что ген Avr4 обладает значительным полиморфизмом первичной структуры, но для выяснения причин этого полиморфизма и характера эволюции этого гена, а также установления частот выявленных аллелей в популяциях P. infestans, необходимо проведение дополнительных популяционно-генетических исследований.

The paper describes the primary structure polymorphism of the oomycete virulence gene Avr4 in field samples of P. infestans from the Moscow and Vladimir regions of Russia. It is found that in nucleotide sequences the Avr4 gene exhibits four site of single nucleotide polymorphism that can be attributed to hot spots of mutagenesis (at 180, 278, 376 and 439). Depending on the nucleotide composition, among the non-functional variants of the Avr4 gene, five allelic variants are identified. Based on these data, it was concluded that the Avr4 gene has considerable polymorphism of the primary structure, but in order to elucidate the causes of this polymorphism and the nature of the evolution of this gene, as well as to establish the allele frequencies in populations of P. infestans, additional population-genetic studies are required.

молекулярная генетикагены вирулентностиаллельфитопатогенmolecular geneticsvirulence genesallelesphytopathogensReferencesВахрушева О.А., Недоспасов С.А. Система врожденного иммунитета у растений // Молекулярная Биология. 2011. Т. 45 (№ 1). С. 20-29.Вахрушева О.А., Недоспасов С.А. Система врожденного иммунитета у растений // Молекулярная Биология. 2011. Т. 45 (№ 1). С. 20-29.Armstrong M.R. An ancestral oomycete locus contains late blight avirulence gene Avr3a, encoding a protein that is recognized in the host cytoplasm / M.R. Armstrong, S.C. Whisson, L. Pritchard et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. Vol. 102. P. 7766-7771.Armstrong M.R. An ancestral oomycete locus contains late blight avirulence gene Avr3a, encoding a protein that is recognized in the host cytoplasm / M.R. Armstrong, S.C. Whisson, L. Pritchard et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. Vol. 102. P. 7766-7771.Bent A.F., Mackey D. Elicitors, Effectors, and R Genes: The New Paradigm and a Lifetime Supply of Questions // Annu. Rev. Phytopathol. 2007. Vol. 45. Р. 399-436.Bent A.F., Mackey D. Elicitors, Effectors, and R Genes: The New Paradigm and a Lifetime Supply of Questions // Annu. Rev. Phytopathol. 2007. Vol. 45. Р. 399-436.Bos J.I. The C-terminal half of Phytophthora infestans RXLR effector AVR3a is sufficient to trigger R3a-mediated hypersensitivity and suppress INF 1-induced cell death in Nicotiana benthamiana / J.I. Bos, T.D. Kanneganti, C. Young et al. // Plant J. 2006. Vol. 48. P. 165-176.Bos J.I. The C-terminal half of Phytophthora infestans RXLR effector AVR3a is sufficient to trigger R3a-mediated hypersensitivity and suppress INF 1-induced cell death in Nicotiana benthamiana / J.I. Bos, T.D. Kanneganti, C. Young et al. // Plant J. 2006. Vol. 48. P. 165-176.Cardenas M. Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region / M. Cárdenas, A. Grajales, R. Sierra et al. // BMC Genet. 2011. Vol. 12 (pub. 23). 13 р.Cardenas M. Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region / M. Cárdenas, A. Grajales, R. Sierra et al. // BMC Genet. 2011. Vol. 12 (pub. 23). 13 р.Elansky S. Genotypic analysis of Russian isolates of Phytophthora infestans from the Moscow Region, Siberia and Far Eeast / S. Elansky, A. Smirnov, Y. Dyakov et al. // J. Phytopathology. 2001. Vol. 149. P. 605-611.Elansky S. Genotypic analysis of Russian isolates of Phytophthora infestans from the Moscow Region, Siberia and Far Eeast / S. Elansky, A. Smirnov, Y. Dyakov et al. // J. Phytopathology. 2001. Vol. 149. P. 605-611.Jiang R. RXLR effector reservoir in two Phytophthora species is dominated by a single rapidly evolving superfamily with more than 700 members / R. Jiang, S. Tripathy, F. Govers et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. Vol. 105. P. 4874-4879.Jiang R. RXLR effector reservoir in two Phytophthora species is dominated by a single rapidly evolving superfamily with more than 700 members / R. Jiang, S. Tripathy, F. Govers et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. Vol. 105. P. 4874-4879.Ristaino J.B., Groves C.T., Parra G.R. PCR amplification of the Irish potato famine pathogen from historic specimens // Nature. 2001. Vol. 411. P. 695-697. 9.Ristaino J.B., Groves C.T., Parra G.R. PCR amplification of the Irish potato famine pathogen from historic specimens // Nature. 2001. Vol. 411. P. 695-697. 9.van Poppel P., Guo J., van de Vondervoort P. et al. The Phytophthora infestans avirulence gene Avr4 encodes an RXLR-dEER effector / P. van Poppel, J. Guo, P. van de Vondervoort et al. // Mol. Plant-Microbe. Interact. 2008. Vol. 21. P. 1460-1470. 10.van Poppel P., Guo J., van de Vondervoort P. et al. The Phytophthora infestans avirulence gene Avr4 encodes an RXLR-dEER effector / P. van Poppel, J. Guo, P. van de Vondervoort et al. // Mol. Plant-Microbe. Interact. 2008. Vol. 21. P. 1460-1470. 10.van Poppel P., Huigen D.J., Govers F. Differential recognition of Phytophthora in-festans races in potato R4 breeding lines // Phytopathology. 2009. Vol. 99 (10). P. 1150-1155. 11.van Poppel P., Huigen D.J., Govers F. Differential recognition of Phytophthora in-festans races in potato R4 breeding lines // Phytopathology. 2009. Vol. 99 (10). P. 1150-1155. 11.van Poppel P. Recognition of Phytophthora infestans Avr4 by potato R4 is triggered by C-terminal domains comprising W motifs / P. van Poppel, R. Jiang, J. Sliwka et al. // Mol. Plant Pathol. 2009. Vol. 10 (5). P. 611-620.van Poppel P. Recognition of Phytophthora infestans Avr4 by potato R4 is triggered by C-terminal domains comprising W motifs / P. van Poppel, R. Jiang, J. Sliwka et al. // Mol. Plant Pathol. 2009. Vol. 10 (5). P. 611-620.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.